近紅外的激發波長一般在700nm以上，常見的有785nm、830nm和1064nm。近紅外激發波長通常用于抑制熒光干擾。熒光需要吸收外來光才能發射。拉曼是一個簡單的光散射過程，沒有吸收。大多數樣品的熒光吸收帶位于可見部分，只有少數材料的吸收帶位于近紅外區域，因此近紅外激光對大多數被測樣品不會產生熒光。另一方面，拉曼則正常出現。當樣品在可見光激發下有較強的熒光干擾時，采用近紅外拉曼光譜是獲得高質量拉曼光譜的好方法。
然而，近紅外激光激發的低效率導致了靈敏度的降低。因此，785nm激光器激發的拉曼強度幾乎是532nm激光器激發的拉曼信號強度的1 / 5;1064nm激光器激發的拉曼信號強度只有532nm激光器激發的拉曼信號強度的1 / 15。此外，CCD探測器在近紅外部分的靈敏度也相對較低，所以與使用可見光激光測量相比，為了獲得相同的光譜質量，近紅外拉曼測量時間相對較長。
紫外激發波長的優點和缺點是什么?
紫外激發波長一般在350nm以下，常用266nm。與近紅外相似，熒光的吸收帶主要在可見波長段，熒光信號與拉曼不在同一區域(熒光也可能發生在近可見波長段)。雖然熒光信號比拉曼信號高很多，但不受熒光的干擾。許多生物樣品(如蛋白質、DNA、RNA等)與紫外激發波長產生共振，拉曼信號多次增強，為此類樣品的結構檢測提供了便利。此外，紫外激光在半導體材料中的穿透深度一般在幾個納米量級，因此可以對被測樣品表面的薄膜進行選擇性分析。紫外波長的激發效率高，可以以較低的功率激發拉曼信號。
但是，由于紫外激發波長的高熱效應，樣品在紫外激光照射下會燃燒或降解。同時，紫外線光束用肉眼是看不到的，紫外線激光體積較大，操作復雜，價格也比較昂貴，所以紫外線拉曼仍然需要專業的技術人員來操作。
在這樣多種激發波長的拉曼光譜儀中(激光器與光譜儀一般是配對的，不可能為同一光譜儀購買多個激發波長的激光器)，根據自身需要檢測樣品的特性，選擇合適的激發波長。應考慮熒光干擾和共振增強。